37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02150 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  100 
 
 
402 aa  823    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  42.32 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  40.57 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  50 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.69 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.6 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.67 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  29.06 
 
 
205 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  26.77 
 
 
202 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 
138 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 
138 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.33 
 
 
134 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.91 
 
 
138 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30 
 
 
139 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.48 
 
 
134 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.03 
 
 
203 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.91 
 
 
134 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.66 
 
 
138 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  28.21 
 
 
141 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  25.83 
 
 
204 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  29.41 
 
 
171 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  31.58 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  26.02 
 
 
205 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  26.67 
 
 
203 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.84 
 
 
204 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  22.31 
 
 
140 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.48 
 
 
134 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  29.57 
 
 
271 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  29.36 
 
 
203 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  27.97 
 
 
314 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  25.42 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 
136 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  28.57 
 
 
203 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.13 
 
 
203 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  26 
 
 
213 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.46 
 
 
129 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  28.3 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>