61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0818 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  69.15 
 
 		 203 aa  300  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  70.15 
 
 		 203 aa  298  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  63.68 
 
 		 203 aa  270  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  61.88 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  44 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  46.46 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.71 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.7 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.19 
 
 		 204 aa  158  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.7 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  39.7 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.67 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0820  translation initiation factor IF-2 subunit beta  52.46 
 
 		 129 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2410  Translation initiation factor IF2/IF5  48 
 
 		 129 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0656  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.17 
 
 		 138 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1300  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.17 
 
 		 138 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.756042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1376  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.4 
 
 		 138 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1308  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.88 
 
 		 138 aa  97.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1501  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.85 
 
 		 139 aa  95.5  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.134545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0380  translation initiation factor IF5  30.83 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00129968  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00740  translation initiation factor, putative  33.06 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15304  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81624  eIF2  32.88 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1412  translation initiation factor IF2/IF5  30.71 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02992  translational initiation factor 2 beta (AFU_orthologue; AFUA_3G08600)  33.86 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46171  predicted protein  34.65 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.516415  normal  0.0761252 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72556  predicted protein  33.33 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88846  predicted protein  33.09 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0540099  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0190  Translation initiation factor IF2/IF5  27.48 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0658  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.46 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000021043  hitchhiker  0.00876921 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47039  predicted protein  35.42 
 
 		 413 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0538  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00412353 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06067  eukaryotic translation initiation factor 5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08990)  33.33 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0582  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.78 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00328068  hitchhiker  0.00124905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0835  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1439  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.23 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  decreased coverage  0.00662959 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0459  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.46 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27282  predicted protein  29.71 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.43 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  36.71 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02150  translation initiation factor, putative  31.13 
 
 		 402 aa  48.9  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  41.07 
 
 		 67 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.74 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.67 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  35.09 
 
 		 79 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  38.18 
 
 		 79 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  36.07 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  38.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  40 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  35.85 
 
 		 63 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  38.6 
 
 		 79 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.12 
 
 		 133 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  35.19 
 
 		 68 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>