More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0974 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 438 aa  846    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  87.38 
 
 		 428 aa  691    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  63.29 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  64.02 
 
 		 430 aa  497  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  52.12 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  25.81 
 
 		 636 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  28.41 
 
 		 649 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 482 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 494 aa  93.2  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 466 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 466 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  26.3 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 477 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.71 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.81 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.81 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  27.25 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.31 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.31 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.82 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.31 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.13 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.06 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.55 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.62 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.99 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.36 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.68 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.61 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  26.2 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.12 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  28.67 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.35 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  21.58 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.64 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.64 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.59 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.59 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  24 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  24 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>