70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0618 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  72.53 
 
 
388 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  69.82 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  58.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  56.04 
 
 
391 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  57.81 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  56.81 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  55.28 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  50.41 
 
 
386 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  49 
 
 
393 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  44.92 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  43.04 
 
 
411 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  43.49 
 
 
411 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  43.75 
 
 
400 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  41.54 
 
 
399 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
415 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
391 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  35.52 
 
 
405 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  37.47 
 
 
406 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  36.71 
 
 
405 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.46 
 
 
420 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  27.27 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  27.07 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.11 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.16 
 
 
443 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  28.05 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  23.66 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.55 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.66 
 
 
424 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
433 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  22.7 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  30.81 
 
 
453 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  22.99 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  27.36 
 
 
429 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  22.92 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.17 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  22.99 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  25.75 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  28.3 
 
 
457 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.7 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.7 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  32.88 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  22.95 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  32.88 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  26.55 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  22.26 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.52 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
451 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.88 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  22.88 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  27.5 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 
431 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.92 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.6 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  25 
 
 
452 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.6 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>