More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0435 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  100 
 
 
209 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  56.18 
 
 
203 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  58.33 
 
 
191 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  56.67 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  59.51 
 
 
196 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  57.14 
 
 
202 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  57.38 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  54.64 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  55.49 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  50.28 
 
 
196 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  54.35 
 
 
201 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  56.67 
 
 
233 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  44.13 
 
 
192 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  50.39 
 
 
185 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  41.82 
 
 
178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  42.37 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  39.44 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.01 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  42.86 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.71 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  44.59 
 
 
193 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40.88 
 
 
198 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  55.56 
 
 
361 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  45.75 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  42.77 
 
 
188 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  43.53 
 
 
189 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  43.53 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  40.64 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  40 
 
 
199 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  39.39 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  43.75 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  43.45 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  43.45 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  44.44 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  44.44 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  44.44 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  44.44 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  43.79 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  37.59 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  43.14 
 
 
212 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  47.83 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  45.45 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  45.45 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  45.45 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  40.8 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.99 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  34.81 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37.43 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  37.36 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  31.35 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.26 
 
 
396 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.8 
 
 
396 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.64 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.8 
 
 
396 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.64 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.8 
 
 
396 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  31.4 
 
 
447 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.89 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  34.2 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.88 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  30.86 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.88 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.88 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  31.58 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  39.39 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.17 
 
 
465 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  32.81 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.54 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.17 
 
 
379 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.88 
 
 
393 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.38 
 
 
428 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  30.57 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.33 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.14 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.69 
 
 
416 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  26.98 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  37.12 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  31.1 
 
 
454 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.5 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  30.51 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  27.06 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.65 
 
 
415 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  37.3 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  34.51 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  25.85 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.57 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.48 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.54 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  29.94 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  29.94 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.38 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  29.26 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  34.78 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.42 
 
 
453 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  31.68 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.43 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  33.33 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.8 
 
 
456 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  33.86 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  30.51 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>