188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2563 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  49.71 
 
 
719 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  100 
 
 
714 aa  1459    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  49.85 
 
 
716 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  63.21 
 
 
712 aa  858    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  51.58 
 
 
715 aa  714    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  50.15 
 
 
708 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  52.98 
 
 
714 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  50.22 
 
 
713 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  52.52 
 
 
715 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  44.6 
 
 
764 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  44.29 
 
 
764 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  45 
 
 
764 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  43.91 
 
 
787 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  44.25 
 
 
752 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  43.89 
 
 
749 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  43.55 
 
 
788 aa  588  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  44.38 
 
 
726 aa  584  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  42.46 
 
 
763 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  43.87 
 
 
728 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  40.22 
 
 
687 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  37.71 
 
 
703 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  39.33 
 
 
884 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  38 
 
 
692 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  36.01 
 
 
715 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  38.03 
 
 
710 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  37.83 
 
 
713 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  38.03 
 
 
710 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  36.83 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  37.89 
 
 
710 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  37.89 
 
 
710 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  37.96 
 
 
681 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.55 
 
 
727 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  36.78 
 
 
873 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  36.63 
 
 
873 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  39.34 
 
 
702 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  36.52 
 
 
886 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  39.56 
 
 
872 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  37.98 
 
 
887 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.98 
 
 
887 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  35.76 
 
 
897 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  37.78 
 
 
872 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  59.54 
 
 
625 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  33.88 
 
 
758 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  35.33 
 
 
704 aa  364  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  33.98 
 
 
699 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
705 aa  357  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  34.98 
 
 
701 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  33.13 
 
 
696 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  38.35 
 
 
727 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.95 
 
 
480 aa  94  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.23 
 
 
444 aa  88.2  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.95 
 
 
357 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.95 
 
 
357 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.95 
 
 
357 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
357 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
357 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  29.95 
 
 
357 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
357 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  29.95 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 
240 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.14 
 
 
334 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.26 
 
 
290 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.45 
 
 
229 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.84 
 
 
358 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.36 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.84 
 
 
356 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.02 
 
 
260 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 
591 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 
404 aa  64.3  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.37 
 
 
453 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.66 
 
 
325 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.38 
 
 
273 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.9 
 
 
347 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.1 
 
 
321 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 
346 aa  62.4  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.78 
 
 
334 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.31 
 
 
507 aa  62  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.99 
 
 
350 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  24.43 
 
 
360 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  28.22 
 
 
373 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  26.61 
 
 
389 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  25.79 
 
 
233 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.79 
 
 
233 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.52 
 
 
257 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
860 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
404 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.02 
 
 
294 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  27.14 
 
 
396 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  27.46 
 
 
386 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.76 
 
 
404 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 
277 aa  58.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.18 
 
 
247 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.98 
 
 
288 aa  57.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.97 
 
 
233 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  27.23 
 
 
382 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>