246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2402 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  100 
 
 
253 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  36.33 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  37.66 
 
 
256 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  37.55 
 
 
254 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.3 
 
 
252 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.78 
 
 
248 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  33.19 
 
 
262 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  31.89 
 
 
255 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  33.08 
 
 
258 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  32.42 
 
 
254 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  33.08 
 
 
258 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  35.42 
 
 
289 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  32.08 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  32.67 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.21 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.33 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.55 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  34.56 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  31.4 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  31.92 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  32.41 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  31.44 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  33.58 
 
 
293 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.88 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.96 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  34.67 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  33.96 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  31.41 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  32.79 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  31.54 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.55 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  35.26 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  31.9 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  35.63 
 
 
266 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.37 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  29.6 
 
 
262 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  35.52 
 
 
262 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  35.48 
 
 
256 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  33.52 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  33.33 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  34.46 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  34.73 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  35.14 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.19 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  35.14 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.84 
 
 
254 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  31.02 
 
 
270 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  34.19 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.11 
 
 
257 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  34.84 
 
 
254 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  36.02 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.11 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  33.85 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  33.61 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  33.85 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  31.84 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.81 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  34 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  33.47 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.03 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.6 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  33.55 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  34.67 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  33.33 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  33.33 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  37.97 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  30.32 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  34.67 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  33.78 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.8 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  33.33 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  31.61 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  33.96 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.75 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  31.14 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  34.48 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  31.3 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  29.68 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  29.49 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  30 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  30.77 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  31.13 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  30 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  36.05 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  36.24 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  30.32 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  30.32 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  30.32 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  30.32 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  33.33 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  33.92 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>