203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1613 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  64.36 
 
 		 760 aa  989    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  100 
 
 		 765 aa  1552    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  65.15 
 
 		 765 aa  979    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  40.9 
 
 		 779 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  36.99 
 
 		 774 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  37.97 
 
 		 757 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  39.45 
 
 		 749 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  37.25 
 
 		 764 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  37.25 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  40.16 
 
 		 777 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  35.17 
 
 		 772 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  40.55 
 
 		 804 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  41.46 
 
 		 760 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  39.51 
 
 		 681 aa  446  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 799 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  36.25 
 
 		 780 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  38.42 
 
 		 775 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  37.63 
 
 		 771 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  40.03 
 
 		 775 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  35.33 
 
 		 770 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  37.13 
 
 		 775 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  36.02 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  36.02 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  35.51 
 
 		 772 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  36.02 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  36.52 
 
 		 772 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  36.36 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  35.87 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  36.02 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  36.02 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  36.21 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  36.36 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  36.02 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  35.87 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  41.22 
 
 		 766 aa  429  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  38.6 
 
 		 795 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  39.76 
 
 		 763 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  36.21 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  35.1 
 
 		 794 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  33.56 
 
 		 780 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  37.1 
 
 		 763 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  36.61 
 
 		 760 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  35.82 
 
 		 823 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 778 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  35.91 
 
 		 712 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 		 695 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.81 
 
 		 752 aa  345  2e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.8 
 
 		 828 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 		 784 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.13 
 
 		 836 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.79 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.07 
 
 		 801 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  34.2 
 
 		 779 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.84 
 
 		 779 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.29 
 
 		 776 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 777 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.07 
 
 		 752 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  31.88 
 
 		 608 aa  290  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.82 
 
 		 803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  33.63 
 
 		 779 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 		 821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  31.03 
 
 		 768 aa  280  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.02 
 
 		 797 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.28 
 
 		 1024 aa  265  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  29.44 
 
 		 839 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  33.33 
 
 		 816 aa  263  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.16 
 
 		 792 aa  260  7e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  26.16 
 
 		 799 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  30.11 
 
 		 743 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.77 
 
 		 794 aa  256  9e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  28.54 
 
 		 755 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.57 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.68 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  30.29 
 
 		 821 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  31.47 
 
 		 806 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  33.27 
 
 		 821 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.89 
 
 		 825 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.14 
 
 		 788 aa  237  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 783 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.61 
 
 		 788 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  30.66 
 
 		 806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.08 
 
 		 788 aa  232  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.63 
 
 		 746 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.95 
 
 		 836 aa  230  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  26.68 
 
 		 845 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.54 
 
 		 791 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 813 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  32.29 
 
 		 803 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.26 
 
 		 791 aa  227  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  31.37 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.88 
 
 		 803 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  29.45 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  30.18 
 
 		 791 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 806 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 806 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  30.07 
 
 		 791 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  30.54 
 
 		 806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  32.66 
 
 		 806 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  31.93 
 
 		 803 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>