203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1418 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  63.47 
 
 		 216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  58.64 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  56.76 
 
 		 219 aa  248  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  58.18 
 
 		 219 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  57.8 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  55.76 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  50.68 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  52.27 
 
 		 295 aa  215  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  52.19 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  48.39 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  56.55 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  36.65 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  34.8 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  34.39 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.27 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  34.16 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.44 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  33.18 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  33.77 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  31.39 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  33.04 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  28.44 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.48 
 
 		 377 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.3 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.56 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.14 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  35.16 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  34.39 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.09 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.84 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.28 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.6 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.82 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.82 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  31.09 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.82 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  31 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  30.09 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.82 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.82 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.6 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.29 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.82 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  32.39 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.82 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.91 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  29.17 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  30.36 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  27.1 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  27.01 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.99 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  31.91 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  32.76 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.7 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  30.14 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  31.49 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  28.51 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  29.55 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.27 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.28 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.3 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.7 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  30.41 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.8 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.95 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  28.05 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.64 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  27.85 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  28.77 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  27.48 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  29.15 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  27.44 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.79 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  25.88 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  25.34 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.89 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  29.38 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  27.03 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  26.36 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  29.15 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  27.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  28.38 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  24.66 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  25.21 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  25.61 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  24.66 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  26.58 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  26.58 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  24.55 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  24.55 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  33.53 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  28.46 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.5 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  27.98 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  30.43 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.76 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>