More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1308 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1308  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  100 
 
 		 385 aa  786    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.49 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  43.32 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.9 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  49.07 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  45.4 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.24 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  41.69 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  44.3 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  52.74 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  36.77 
 
 		 374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.55 
 
 		 353 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4639  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  51.37 
 
 		 358 aa  243  6e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.16 
 
 		 352 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.29 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  49.41 
 
 		 527 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  42.14 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.14 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  39.56 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  42.18 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.52 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  43.24 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.09 
 
 		 353 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 376 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 380 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  41.1 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  42.34 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.53 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  42.04 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 333 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.52 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  41.95 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 353 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.08 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  52.67 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  42.11 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.37 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  37.32 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 343 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  37.7 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.67 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.85 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  52.67 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.4 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  37.47 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  47.17 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2815  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.14 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.66 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.33 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.47 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.33 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  40.82 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.6 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  49.8 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.05 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  49.8 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  49.8 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  43.16 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  40.38 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.54 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  54.35 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.21 
 
 		 357 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 365 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  49 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 353 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  38.67 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  39.68 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>