148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2201 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 177 aa  337  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  53.67 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  48 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  48 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  49.43 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  45.09 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  49.2 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.78 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  38.51 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  35.8 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  35.8 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  34.3 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.88 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  34.3 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  34.88 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  37.42 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  37.42 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.87 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  29.48 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  32.3 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  34.26 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.04 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.68 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.23 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.38 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.49 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  27.17 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.67 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.17 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.92 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  29.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  27.92 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.36 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  28.87 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.12 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.19 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.97 
 
 		 264 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  28.78 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.83 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.92 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.53 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  24.2 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>