More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4497 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  83.55 
 
 
392 aa  658    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
385 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  80.41 
 
 
390 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  82.08 
 
 
398 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  75.79 
 
 
378 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4721  NADH dehydrogenase (quinone)  77.52 
 
 
385 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  77.52 
 
 
388 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0320  NADH dehydrogenase (quinone)  53.97 
 
 
358 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  45.36 
 
 
367 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  45.36 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.73 
 
 
404 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.58 
 
 
373 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.62 
 
 
367 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 
366 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  42.03 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.38 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.18 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.33 
 
 
389 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.77 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.85 
 
 
792 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.82 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.33 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  40.8 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.37 
 
 
400 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.07 
 
 
791 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.2 
 
 
395 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.15 
 
 
390 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.38 
 
 
358 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 
400 aa  296  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 
390 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
400 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 
395 aa  292  7e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  38.24 
 
 
408 aa  292  8e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 
400 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.27 
 
 
793 aa  288  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.55 
 
 
415 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  39.57 
 
 
371 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.97 
 
 
411 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.56 
 
 
403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.95 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  40.49 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.34 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.98 
 
 
580 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  40.92 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.6 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.82 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.07 
 
 
394 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.17 
 
 
394 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.17 
 
 
394 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  36.12 
 
 
452 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.47 
 
 
394 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.87 
 
 
441 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.23 
 
 
592 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.17 
 
 
394 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  36.8 
 
 
408 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  37.44 
 
 
417 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.4 
 
 
367 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1328  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.76 
 
 
581 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13144  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  37.05 
 
 
475 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  37.44 
 
 
424 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.4 
 
 
394 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.47 
 
 
395 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 
420 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.47 
 
 
395 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  36.68 
 
 
416 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.47 
 
 
395 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.22 
 
 
395 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.21 
 
 
394 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.72 
 
 
394 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.29 
 
 
608 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 
406 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  37.92 
 
 
417 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.43 
 
 
587 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  36.55 
 
 
408 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  37.92 
 
 
417 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.56 
 
 
408 aa  276  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.74 
 
 
560 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.4 
 
 
394 aa  276  6e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  37.68 
 
 
417 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>