55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3389 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  50.3 
 
 
176 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  48.8 
 
 
174 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  45.56 
 
 
176 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  45.62 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  43.23 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  41.57 
 
 
179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  37.72 
 
 
179 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  42.68 
 
 
186 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  40.99 
 
 
247 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  41.45 
 
 
282 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  36.2 
 
 
371 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  38.22 
 
 
186 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  36.54 
 
 
255 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  33.53 
 
 
283 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  33.53 
 
 
291 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  38.51 
 
 
245 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  38.65 
 
 
243 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  34.78 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  34.21 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.31 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  34.18 
 
 
479 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  31.3 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
174 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  29.89 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  29.89 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 
189 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
219 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  30.56 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25.76 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  29.23 
 
 
227 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  28.44 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  25.87 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  25.81 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.4 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  30.56 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  27.06 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32.1 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  31.15 
 
 
229 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  30.61 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  31.13 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  24.68 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  23.08 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  34.43 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  31.43 
 
 
178 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  29.33 
 
 
575 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  23.38 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  27.14 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>