More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1136 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  764    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 382 aa  229  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  33.97 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  33.07 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  33.07 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.8 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  33.51 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  32.25 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  32.8 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  31.03 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  32.88 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  32.88 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  31.48 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  30.52 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  28.42 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  31.62 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  31.71 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  31.79 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  31.12 
 
 		 373 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  29.81 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  29.32 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  30.03 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  29.66 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  32.62 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.99 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  31.99 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  30.75 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  28.94 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  27.65 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  31.02 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  30.4 
 
 		 373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.08 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  28.27 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  28.61 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  30.75 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.21 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>