244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1646 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1646  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.041881  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 257 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  42.17 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  37.5 
 
 		 364 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 259 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 479 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  43.75 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  38.82 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  44.12 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  41.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 241 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.16 
 
 		 464 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  41.67 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  47.8  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  30.88 
 
 		 368 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  43.33 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  31.25 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  42.65 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  44.26 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 261 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.5 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  44.07 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.76 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 240 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.06 
 
 		 495 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  43.86 
 
 		 240 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 241 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 259 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  41.18 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  43.4 
 
 		 454 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  46 
 
 		 241 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.88 
 
 		 476 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  45.76 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.9 
 
 		 468 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 453 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  41.94 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  35.53 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  37.31 
 
 		 288 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>