More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4876 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  63.74 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27100  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  41.56 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  45.57 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.81 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 259 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  47.89 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  39.19 
 
 		 368 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  37.5 
 
 		 260 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  42.65 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  35.9 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  40.91 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.42 
 
 		 447 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  41.79 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  40.85 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 460 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  42.65 
 
 		 493 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  39.68 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  39.68 
 
 		 245 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  43.06 
 
 		 243 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  37.5 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  39.51 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  39.68 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  39.68 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  42.25 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.95 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  36.92 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.16 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  43.75 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  37.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.33 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.39 
 
 		 504 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.75 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  35.82 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  32.81 
 
 		 342 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>