More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1110 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  79.67 
 
 		 429 aa  687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 449 aa  871    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.21 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.14 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.78 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.78 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.78 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  47.2 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  45.75 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.65 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  41.47 
 
 		 450 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.22 
 
 		 456 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.57 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 449 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  38.48 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  38.48 
 
 		 484 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.2 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.62 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.36 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 453 aa  282  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 457 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.12 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.63 
 
 		 430 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  40.27 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.55 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  38.96 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  38.96 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  38.96 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  38.39 
 
 		 482 aa  262  8e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  35.96 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.27 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 435 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 465 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  39.49 
 
 		 438 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  38.53 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  36 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.1 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.37 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 442 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  36.21 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.6 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.41 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.36 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  35.41 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  39.29 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>