More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0316 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  87.27 
 
 
173 aa  307  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.14 
 
 
323 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.44 
 
 
291 aa  282  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.78 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.14 
 
 
188 aa  280  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  81.82 
 
 
188 aa  273  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  66.43 
 
 
173 aa  194  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  61.7 
 
 
268 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  61.7 
 
 
268 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  65.71 
 
 
190 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  63.19 
 
 
189 aa  193  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65 
 
 
176 aa  192  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  66.43 
 
 
184 aa  192  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  64.75 
 
 
189 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  65.71 
 
 
190 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  64.03 
 
 
189 aa  191  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  63.57 
 
 
189 aa  190  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
264 aa  189  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  64.03 
 
 
190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
250 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.23 
 
 
176 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.04 
 
 
251 aa  185  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 
170 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.15 
 
 
202 aa  184  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.76 
 
 
170 aa  184  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.04 
 
 
225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  62.32 
 
 
787 aa  180  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.26 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
172 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
179 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
179 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
179 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
222 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
222 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  62.22 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.08 
 
 
169 aa  177  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.57 
 
 
191 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  56.34 
 
 
185 aa  177  4.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
249 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
249 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.87 
 
 
200 aa  176  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.41 
 
 
170 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
160 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
174 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
222 aa  176  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
160 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
174 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  54.86 
 
 
179 aa  176  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.23 
 
 
168 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.44 
 
 
191 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
177 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
173 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.06 
 
 
196 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  59.71 
 
 
166 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
179 aa  176  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
170 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 
172 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.62 
 
 
167 aa  175  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
168 aa  175  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
246 aa  175  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.16 
 
 
200 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  54.74 
 
 
166 aa  175  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.15 
 
 
211 aa  174  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  57.89 
 
 
170 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 
200 aa  174  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
159 aa  174  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
244 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 
177 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  54.17 
 
 
182 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.08 
 
 
179 aa  174  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
186 aa  173  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
167 aa  173  9e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  58.65 
 
 
228 aa  173  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  58.57 
 
 
252 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  52.08 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0658  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55 
 
 
293 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  59.29 
 
 
244 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
250 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>