76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0296 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0296  NLP/P60 protein  100 
 
 		 561 aa  1112    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0307  hypothetical protein  42.49 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0548875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 		 581 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0302  hypothetical protein  24.7 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.75986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  26.72 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  32.53 
 
 		 278 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 220 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  30.28 
 
 		 318 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 319 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  29.57 
 
 		 207 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.84 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 192 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 192 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 202 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 301 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  32.41 
 
 		 225 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  36 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  36 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  32.71 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  32.71 
 
 		 201 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  30.43 
 
 		 231 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 223 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1074  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 215 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 178 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  32.08 
 
 		 226 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  30.53 
 
 		 224 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  30 
 
 		 174 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 224 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  31.45 
 
 		 298 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  33 
 
 		 223 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  33 
 
 		 223 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  31.13 
 
 		 228 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  33 
 
 		 223 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  38.75 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  29.77 
 
 		 257 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  32.41 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.52 
 
 		 2122 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  27.39 
 
 		 266 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  33 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 234 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.03 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  33 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  29.37 
 
 		 275 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  27.52 
 
 		 232 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 398 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  29.25 
 
 		 169 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 295 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  32.08 
 
 		 222 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 205 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  28.76 
 
 		 284 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 255 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  27.56 
 
 		 188 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 159 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  26.97 
 
 		 307 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 173 aa  43.5  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>