More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1532 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  100 
 
 
248 aa  500  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  57.38 
 
 
261 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  59.07 
 
 
246 aa  292  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  62.13 
 
 
238 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  61.18 
 
 
240 aa  288  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  58.4 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  59.24 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  58.58 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  57.5 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  57.02 
 
 
257 aa  280  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  59.49 
 
 
258 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  57.14 
 
 
245 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  57.08 
 
 
247 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  59.66 
 
 
250 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  56.38 
 
 
248 aa  277  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  58.4 
 
 
261 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.07 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  57.45 
 
 
238 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  57.63 
 
 
237 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  59.07 
 
 
243 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  56.9 
 
 
238 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  57.87 
 
 
238 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  57.81 
 
 
241 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  59.31 
 
 
243 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  58.72 
 
 
241 aa  268  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  53.91 
 
 
232 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  53.81 
 
 
258 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  54.89 
 
 
237 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  56.9 
 
 
239 aa  266  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  56.54 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  58.65 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  58.65 
 
 
244 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  58.01 
 
 
237 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  55.27 
 
 
255 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  58.37 
 
 
242 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  58.37 
 
 
242 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  57.45 
 
 
244 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  54.89 
 
 
239 aa  262  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  57.14 
 
 
237 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  54.01 
 
 
239 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  56.36 
 
 
238 aa  262  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  55.41 
 
 
235 aa  261  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  55.41 
 
 
235 aa  261  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  261  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  54.51 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  57.14 
 
 
239 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  57.38 
 
 
256 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  55.27 
 
 
239 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  54.24 
 
 
238 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  54.51 
 
 
239 aa  260  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  52.77 
 
 
237 aa  260  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  57.14 
 
 
239 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  57.14 
 
 
239 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  54.47 
 
 
237 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  57.02 
 
 
238 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  54.85 
 
 
245 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  54.7 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  53.81 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  54.43 
 
 
246 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  56.6 
 
 
237 aa  258  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  55.32 
 
 
239 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  54.47 
 
 
237 aa  258  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  54.51 
 
 
239 aa  257  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  55.36 
 
 
239 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  55.27 
 
 
245 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  56.83 
 
 
237 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  55.27 
 
 
239 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  54.2 
 
 
240 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  54.2 
 
 
240 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  54.55 
 
 
238 aa  256  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  55.36 
 
 
239 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  56.84 
 
 
241 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  53.78 
 
 
240 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  55.51 
 
 
237 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  54.85 
 
 
239 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  56.78 
 
 
241 aa  255  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.17 
 
 
238 aa  255  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  55.07 
 
 
238 aa  254  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  54.89 
 
 
237 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  54.89 
 
 
237 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  54.89 
 
 
237 aa  254  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  53.85 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  58.44 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  54.47 
 
 
237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  51.74 
 
 
231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  54.66 
 
 
237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  55.27 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2943  ribonuclease PH  55.74 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  54.47 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  53.42 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  52.94 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  56.54 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>