More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1550 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  97.63 
 
 		 379 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 379 aa  778    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  39.46 
 
 		 392 aa  278  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  41.84 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  36.97 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  37.27 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  38.38 
 
 		 868 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.81 
 
 		 392 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.79 
 
 		 392 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  39.84 
 
 		 390 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  39.4 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.35 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.75 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  41.52 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  38.52 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  36.31 
 
 		 394 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.34 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.15 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  36.68 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.36 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  34.83 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  35.36 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  34.83 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  35.36 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.91 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  35.36 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  37.03 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.56 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  36.44 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.5 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  36.94 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  33.94 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  35.22 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  35.54 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  35.51 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.85 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.06 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.77 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  35.62 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  36.29 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  33.24 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  37.25 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  35.33 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.27 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  36.44 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  36.44 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  36.44 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  34.67 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  34.11 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  36.83 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  34.73 
 
 		 398 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 		 391 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  34.84 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.41 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  35.71 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.6 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  35.66 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  35.89 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.87 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  34.46 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.08 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.08 
 
 		 387 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.41 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.29 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  36.56 
 
 		 386 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.42 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.42 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  35.87 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  36.27 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  35.46 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  33.51 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  33.59 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  36.09 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.78 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>