More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0651 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 157 aa  84.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  37.4 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.83 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  25.85 
 
 		 255 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  29.37 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  28.08 
 
 		 217 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 250 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  35.35 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  30.26 
 
 		 277 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  26.62 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  26.28 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  27.08 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  26.9 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  27.27 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.39 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  40 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  34.94 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  33.72 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  25.5 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  34.94 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  40.58 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>