More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0332 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  100 
 
 		 141 aa  280  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  94.33 
 
 		 141 aa  243  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  50.72 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  43.33 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  42.42 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  50.78 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  45.07 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  40.88 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  44.67 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  41.26 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  40.77 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  43.07 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  40 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.22 
 
 		 180 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 181 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 190 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  41.46 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  34.75 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 181 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  39.57 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 166 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 176 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  34.04 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  31.76 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.21 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  32.62 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  45.92 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  31.76 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 171 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 180 aa  87.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 183 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 186 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 171 aa  87.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  34.35 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.07 
 
 		 188 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.09 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 167 aa  86.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 185 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  40 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  38.28 
 
 		 192 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  43 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 183 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 184 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 234 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>