146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0170 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  79.78 
 
 
991 aa  759    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0170  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
454 aa  929    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  52.11 
 
 
885 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0061  glycosyl transferase group 1  51.99 
 
 
478 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  46.77 
 
 
780 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0513  glycosyl transferase, group 1  41.43 
 
 
924 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 
711 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
540 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4979  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
332 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  24.09 
 
 
714 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.72 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  23.72 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2527  glycosyltransferase  25 
 
 
726 aa  84  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3848  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
751 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08950  glycosyltransferase  27.08 
 
 
731 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.691292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27940  glycosyltransferase  24.92 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4969  glycosyltransferase  25.83 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26690  glycosyltransferase  23.88 
 
 
644 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.95 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  26.81 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.79 
 
 
810 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
878 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  26.09 
 
 
350 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.81 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  23.38 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09050  hypothetical protein  21.85 
 
 
611 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.06128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
350 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  26.81 
 
 
350 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  23.91 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
371 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.3 
 
 
391 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  26.62 
 
 
341 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
358 aa  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
398 aa  50.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
538 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  27.66 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
353 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
388 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.51 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
396 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
1267 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
355 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.85 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.71 
 
 
342 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  27.22 
 
 
383 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
503 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  24.22 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  28.68 
 
 
358 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
3145 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22820  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
391 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
471 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  22.62 
 
 
550 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
448 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
408 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
397 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
365 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  22.75 
 
 
389 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
503 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  22.02 
 
 
550 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.11 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  24.74 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
750 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  23.9 
 
 
507 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 
632 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  20.6 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  22.34 
 
 
390 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  26.14 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  25 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.11 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  23.27 
 
 
500 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
573 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>