57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0861 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  818    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  50.37 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  48.16 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  50 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  47.34 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  46.61 
 
 		 409 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  41.48 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.13 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.13 
 
 		 263 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 260 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  28.25 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  38.67 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.86 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 307 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  28.21 
 
 		 566 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  37.7 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  23.62 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 285 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  31.88 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  30.23 
 
 		 258 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  36.23 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  25.47 
 
 		 318 aa  46.6  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0650  hypothetical protein  35.8 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.918476  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  26.26 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.25 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.25 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  31.25 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 267 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  23.56 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  32 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  31.43 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  22.76 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  30.43 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  41.82 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  41.82 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  32.81 
 
 		 293 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  41.82 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  41.82 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  41.82 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  33.9 
 
 		 293 aa  43.1  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  32.84 
 
 		 189 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  32.84 
 
 		 189 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>