230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0659 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 230 aa  440  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  45.16 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.46 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.03 
 
 		 623 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 264 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  32.75 
 
 		 266 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.88 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  28.88 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.37 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  29.17 
 
 		 185 aa  86.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  33.53 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.37 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.76 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  36.53 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.69 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.18 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.12 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  35.61 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.12 
 
 		 746 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.81 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.14 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.14 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.14 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.14 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  34.62 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  29.36 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  28.26 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  31.14 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  28.26 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.14 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.95 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  35.93 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.13 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  34.92 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.85 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  33.13 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.53 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.93 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  32.65 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.45 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  32.08 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.89 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  21.76 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.99 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  27.78 
 
 		 713 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  31.76 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  29.06 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  32 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  33.78 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  30.98 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  30.81 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  26.74 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  31.54 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  23.28 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  25.22 
 
 		 714 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.31 
 
 		 716 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  28.8 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  26.17 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  25.23 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  27.42 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  29.85 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.61 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  33.06 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  34.38 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  30.18 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.8 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  29.02 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  28.8 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>