More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2186 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  100 
 
 		 551 aa  1127    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  45.02 
 
 		 564 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  43.32 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 564 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.68 
 
 		 557 aa  289  8e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 610 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.22 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 1557 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 610 aa  226  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.79 
 
 		 610 aa  226  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 607 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 633 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 812 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 609 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 610 aa  223  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 605 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.7 
 
 		 1537 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 825 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 1538 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 1538 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 824 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 602 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 633 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  27.05 
 
 		 602 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 620 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 825 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 576 aa  213  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 		 601 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.71 
 
 		 592 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 602 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  29.95 
 
 		 824 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  30.12 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  29.32 
 
 		 824 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 580 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 663 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  30.61 
 
 		 607 aa  206  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 887 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.16 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 605 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 590 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  31.39 
 
 		 811 aa  203  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.7 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  34.52 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 630 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.85 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  27.68 
 
 		 611 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 599 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 819 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 604 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 605 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 647 aa  197  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 603 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 604 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 		 669 aa  196  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 		 602 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  26.94 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.11 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  30.16 
 
 		 555 aa  193  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 598 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  28.57 
 
 		 679 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  29.52 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  26.92 
 
 		 588 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 601 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 602 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 652 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 826 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 601 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 672 aa  190  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.09 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 596 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.11 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 601 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>