294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2202 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  100 
 
 
165 aa  343  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  75 
 
 
165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  74.39 
 
 
165 aa  271  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  73.78 
 
 
165 aa  269  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  72.56 
 
 
168 aa  263  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  70.73 
 
 
167 aa  259  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  71.95 
 
 
165 aa  251  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  71.95 
 
 
165 aa  251  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  66.67 
 
 
189 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  66.87 
 
 
174 aa  239  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  62.42 
 
 
168 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  65.66 
 
 
174 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  61.82 
 
 
168 aa  230  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  61.21 
 
 
168 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  63.86 
 
 
185 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  63.86 
 
 
185 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  62.65 
 
 
185 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  61.82 
 
 
187 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  45.45 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50.6 
 
 
166 aa  160  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  46.99 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.94 
 
 
174 aa  158  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  51.19 
 
 
168 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  50.89 
 
 
197 aa  157  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  52.38 
 
 
189 aa  157  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.77 
 
 
171 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  48.15 
 
 
177 aa  154  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  44.31 
 
 
172 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  50.6 
 
 
174 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  49.7 
 
 
213 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50.34 
 
 
173 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  43.98 
 
 
169 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  42.17 
 
 
170 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  49.66 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  43.29 
 
 
171 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  45.12 
 
 
162 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  44.44 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  49.31 
 
 
169 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  44.9 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  45.58 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  47.18 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  43.56 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  44.08 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  43.45 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  42.51 
 
 
180 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  47.22 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  42.33 
 
 
176 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  41.18 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  42.33 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  45.77 
 
 
196 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  42.51 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  35.71 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  45.95 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.52 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  44.03 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  43.45 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  47.18 
 
 
177 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  47.1 
 
 
177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.12 
 
 
204 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  40.94 
 
 
182 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  43.2 
 
 
186 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  45 
 
 
166 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  44.68 
 
 
183 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  46.53 
 
 
184 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  44.83 
 
 
166 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  42.26 
 
 
220 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.36 
 
 
160 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  37.57 
 
 
198 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  39.75 
 
 
178 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  37.57 
 
 
198 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  46.21 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  41.67 
 
 
221 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  45.83 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.66 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  40.96 
 
 
164 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.77 
 
 
183 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  39.88 
 
 
222 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  35 
 
 
197 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  42.55 
 
 
166 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  39.29 
 
 
205 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  41.67 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.88 
 
 
189 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  38.24 
 
 
167 aa  117  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.03 
 
 
169 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  49.64 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  43.75 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  38.6 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  35.71 
 
 
198 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  42.36 
 
 
185 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  39.29 
 
 
196 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.77 
 
 
185 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  38.6 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  38.6 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  36.31 
 
 
194 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  36.31 
 
 
194 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  38.01 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  36.9 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  42.36 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  39.29 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  39.29 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>