More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0543 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  50.84 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  52.44 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  44.51 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  45.66 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  45.66 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 		 230 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 216 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 		 192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  41.04 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.17 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  38.6 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  43.31 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  34.3 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  39.67 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  31.07 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  35.86 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  34.4 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  35.86 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.5 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  34.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  34.25 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  34.25 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  34.34 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  34.59 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.79 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  38.41 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  38.41 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  37.68 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.53 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.53 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.53 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  33.56 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  33.15 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  34.88 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  34.4 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>