228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2673 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  100 
 
 		 350 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  62.67 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  51.47 
 
 		 372 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  45.14 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  37.75 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.61 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  28.86 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.86 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  26.74 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 369 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.54 
 
 		 372 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 440 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 		 385 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.83 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.8 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.64 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.81 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.05 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  29.44 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.34 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  29.93 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  25.88 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.85 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.53 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  26.69 
 
 		 652 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  34.85 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.32 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.46 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.58 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  28.12 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.8 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  36.03 
 
 		 1033 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  26.87 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.34 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.25 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  28.71 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.25 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  24.38 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.16 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 433 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  25.73 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.26 
 
 		 657 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  31.02 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 		 666 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  25.06 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0056  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28 
 
 		 652 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  22.74 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>