284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2004 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.19 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.79 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.56 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.14 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  25.62 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.29 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  25.12 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.7 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  26.41 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  27.14 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.22 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  26.63 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  24.12 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  24.12 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  22.11 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  22.61 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.34 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.46 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  22.11 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  22.11 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  22.11 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.33 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  27.67 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  24.19 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.54 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  24.65 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  26.15 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.15 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  20.16 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  26.7 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  22.11 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  26.58 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  28.74 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  24.86 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  21.94 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  23 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  25.93 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.16 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  26.03 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1658  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  22.61 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.31 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>