74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0191 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  277  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  57.69 
 
 		 192 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  48.92 
 
 		 204 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  53.85 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  56.72 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  43.82 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  55.22 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  55.22 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  43.82 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  46.15 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  52.31 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  52.24 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  46.15 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 		 835 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  30.4 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  43.08 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  26.72 
 
 		 814 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 		 872 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 502 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  29.76 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  28.43 
 
 		 780 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 529 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  32.97 
 
 		 809 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  30.48 
 
 		 814 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 502 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 502 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  28.81 
 
 		 846 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 640 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  25.9 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  30.4 
 
 		 472 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 509 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 512 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 782 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 		 826 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  31.93 
 
 		 526 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 504 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  33.33 
 
 		 824 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 526 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  37.66 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 833 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 568 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 		 781 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  31.36 
 
 		 650 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 736 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 		 781 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  34.33 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  33.03 
 
 		 837 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 513 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 514 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.48 
 
 		 513 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 513 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  31.73 
 
 		 835 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 473 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 		 485 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 761 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 762 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 627 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0129  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  33.87 
 
 		 540 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  24.58 
 
 		 831 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.77 
 
 		 607 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 786 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 815 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 815 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 815 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 581 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 787 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.93 
 
 		 735 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 527 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  48.65 
 
 		 599 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  26.67 
 
 		 796 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>