255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2183 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1170    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  43.55 
 
 		 387 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 657 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  30.94 
 
 		 660 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  33.7 
 
 		 546 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  27.5 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  31.55 
 
 		 748 aa  93.6  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  30.2 
 
 		 834 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.74 
 
 		 629 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.05 
 
 		 4630 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  30.98 
 
 		 805 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  32.64 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.63 
 
 		 1009 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 1321 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  31.11 
 
 		 693 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  28.11 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  28.49 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.5 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 		 1821 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 		 1328 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  29.05 
 
 		 1223 aa  77  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  29.28 
 
 		 1208 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  29.17 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  29.44 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  25.38 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  26.4 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  30 
 
 		 767 aa  73.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  30.21 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  30.3 
 
 		 926 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.79 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  31.38 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  27.93 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  29.51 
 
 		 820 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1194 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  26.5 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.02 
 
 		 920 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  28.5 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  31.18 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  30.15 
 
 		 935 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  28.89 
 
 		 288 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.53 
 
 		 995 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  25.65 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.5 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.07 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  28.28 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.8 
 
 		 1226 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.68 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  26.06 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  38.1 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  26.82 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  25.13 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  27.18 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  25.13 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  27.55 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  25.13 
 
 		 461 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  29.21 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  28.08 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  29.79 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  24.73 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  25.41 
 
 		 1710 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.41 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  27.75 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.13 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  28.11 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  29.31 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  55.81 
 
 		 935 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 1234 aa  60.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.06 
 
 		 921 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  27.19 
 
 		 2117 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  28.64 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  47.17 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  29.31 
 
 		 579 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.71 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.89 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  26.97 
 
 		 1081 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  26.52 
 
 		 1421 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  27.27 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.89 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.14 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.2 
 
 		 932 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1932  S-layer-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 1001 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.446643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.67 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2633  S-layer domain protein  23.67 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.17 
 
 		 1042 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  26.49 
 
 		 375 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  25.28 
 
 		 1174 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.76 
 
 		 6885 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.2 
 
 		 3027 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3982  S-layer domain protein  34 
 
 		 191 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000900515  hitchhiker  0.0000861085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.23 
 
 		 1661 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  24.6 
 
 		 585 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  28.02 
 
 		 554 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  23.4 
 
 		 697 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  24.86 
 
 		 530 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  26.37 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.08 
 
 		 2073 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  28.49 
 
 		 876 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>