116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1932 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1932  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 1001 aa  2031    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.446643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0288  hypothetical protein  40.13 
 
 		 906 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2342  S-layer domain protein  24.05 
 
 		 1010 aa  82  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  23.15 
 
 		 748 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0124  s-layer protein  32.83 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  30.4 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  33.5 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  30.91 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  30.91 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  30.91 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  28.17 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  29.33 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  29.11 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  29.36 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  30.33 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  32.2 
 
 		 218 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  32.2 
 
 		 218 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  32.2 
 
 		 218 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0851  S-layer domain-containing protein  26.1 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  28 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  28.85 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  31.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1049  S-layer protein  27.35 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  25.52 
 
 		 880 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  27.35 
 
 		 219 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.14 
 
 		 766 aa  60.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  28.97 
 
 		 266 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  26.94 
 
 		 219 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  31.03 
 
 		 220 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  27.66 
 
 		 257 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.62 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  25.1 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  30 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  26.94 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  27.47 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  27.48 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4160  S-layer domain protein  27.83 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  27.48 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  27.48 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.87 
 
 		 766 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.87 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  27.48 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  26.4 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  28.04 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  25.13 
 
 		 504 aa  57.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.14 
 
 		 542 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  28.24 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1025  S-layer protein  28.97 
 
 		 285 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.7 
 
 		 765 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  27.78 
 
 		 492 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  28.24 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  26.4 
 
 		 466 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  23.86 
 
 		 834 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1179  S-layer domain protein  27.39 
 
 		 218 aa  57  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  28.24 
 
 		 510 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  27.38 
 
 		 492 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  28.84 
 
 		 502 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  27.27 
 
 		 492 aa  55.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  26.51 
 
 		 272 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  24.76 
 
 		 760 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  26.92 
 
 		 272 aa  53.5  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  26.64 
 
 		 360 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.67 
 
 		 779 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  28.14 
 
 		 459 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.54 
 
 		 459 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  25.12 
 
 		 470 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.54 
 
 		 459 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  26.32 
 
 		 586 aa  52.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0852  S-layer domain-containing protein  27.89 
 
 		 214 aa  52.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  25.12 
 
 		 470 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.65 
 
 		 470 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0234  S-layer protein  27.72 
 
 		 241 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  25.26 
 
 		 463 aa  51.6  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  30.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  30.35 
 
 		 219 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  24.27 
 
 		 760 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  26.8 
 
 		 383 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  26.8 
 
 		 383 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  26.8 
 
 		 383 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  24.02 
 
 		 4630 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  22.6 
 
 		 387 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 		 225 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  29.09 
 
 		 360 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  22.8 
 
 		 805 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  32.61 
 
 		 914 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  29.09 
 
 		 360 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  29.09 
 
 		 360 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  29.09 
 
 		 360 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.88 
 
 		 6885 aa  48.5  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  24.34 
 
 		 693 aa  48.5  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  24.88 
 
 		 223 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 939 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  24.07 
 
 		 344 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  26.64 
 
 		 360 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1026  S-layer protein  25.49 
 
 		 223 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00354744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  22.93 
 
 		 3320 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  22.94 
 
 		 660 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  27.36 
 
 		 754 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 376 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  25 
 
 		 331 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>