141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1112 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  43.89 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  44.57 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  44.75 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  43.5 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  44.32 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  44.02 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  44.02 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  44.02 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  45.2 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  43.48 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  43.48 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  43.48 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  42.93 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  43.26 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  42.37 
 
 		 209 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  43.65 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  42.93 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  45.2 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  41.49 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  41.3 
 
 		 203 aa  127  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  42.93 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  41.34 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  41.08 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  41.44 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  39.47 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  39.33 
 
 		 214 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  41.67 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  40 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  41.01 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  35.48 
 
 		 358 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  39.15 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  41.9 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  41.9 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  41.24 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  41.24 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  39.01 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  38.3 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  37.77 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  36.7 
 
 		 357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  36.26 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  38.89 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  38.3 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  34.78 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  37.02 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  36.81 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  36.22 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  36.67 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  35.91 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  35.71 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  36.46 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  36.56 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  34.85 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  38.46 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.07 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  38.8 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  30.39 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  27.37 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  29.26 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  26.46 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  25.82 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  28.34 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  28.19 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.42 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  28.88 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02120  thymidine kinase  28.3 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  26.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  26.84 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  25 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1574  thymidine kinase  25.89 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.630387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  27.51 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  29.73 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  26.88 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  27.66 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  27.13 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  25.81 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  27.13 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  25.27 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  25.26 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  27.13 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  29.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  26.34 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  25.81 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  25.81 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  27.13 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  27.66 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  25.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  26.98 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  26.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  26.34 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  26.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  26.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  25.53 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  26.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>