More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1046 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  100 
 
 		 564 aa  1154    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  48 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  45.24 
 
 		 581 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  42.18 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  40.11 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  38.65 
 
 		 531 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  36.82 
 
 		 553 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  35.17 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 551 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 551 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  37.61 
 
 		 534 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 551 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 553 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 551 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  34.44 
 
 		 547 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  33.95 
 
 		 576 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.35 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  35.59 
 
 		 530 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.27 
 
 		 593 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 549 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  32.88 
 
 		 574 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  33.52 
 
 		 571 aa  296  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.1 
 
 		 627 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  34.38 
 
 		 497 aa  289  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  34.17 
 
 		 535 aa  289  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  35.25 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.88 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  33.33 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.1 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.91 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.04 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 571 aa  280  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.41 
 
 		 510 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.64 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.64 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.47 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  33.6 
 
 		 478 aa  269  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.61 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.13 
 
 		 641 aa  257  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.19 
 
 		 548 aa  256  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.28 
 
 		 568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.08 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.45 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.27 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 569 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.17 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  34.06 
 
 		 495 aa  244  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  35.23 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 568 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.44 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.38 
 
 		 568 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.07 
 
 		 526 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.04 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.15 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.37 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  32.75 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.3 
 
 		 573 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.88 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.88 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.75 
 
 		 568 aa  233  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 558 aa  230  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  31.98 
 
 		 477 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.95 
 
 		 471 aa  230  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.09 
 
 		 540 aa  230  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.64 
 
 		 537 aa  229  9e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.35 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.24 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.63 
 
 		 566 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  31.08 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.81 
 
 		 562 aa  224  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  31.77 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.19 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.69 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.16 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  29.19 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.3 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  32.88 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  30.51 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.06 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  32.15 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  29.84 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.2 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.07 
 
 		 810 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>