More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0529 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  49.26 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  49.03 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.29 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.34 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  47.16 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.92 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  48.38 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  47.92 
 
 		 361 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  48.12 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  45.88 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 365 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  46.92 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.54 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  47.23 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  47.11 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  48.73 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.88 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  46.78 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  46.92 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.86 
 
 		 354 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  43.51 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  48.02 
 
 		 364 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  46.69 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  299  7e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  45.73 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.26 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.64 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>