More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0274 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 257 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  50.8 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 655 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 650 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 654 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 243 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 298 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  42.41 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0915  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 240 aa  211  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  44.06 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 646 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  47.72 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  45.17 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 241 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  42.41 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>