More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0915 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0915  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  46.27 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 254 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  47.98 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  48.36 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  45.27 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.62 
 
 		 655 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  44.94 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  44.21 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 654 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  42.31 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  43.21 
 
 		 298 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  43.82 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>