More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4501 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  57.14 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  51.23 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  51.82 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  49.38 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  51.63 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  51.63 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  46.09 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  46.96 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  43.67 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  46.22 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  47.77 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  39.67 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  39.42 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  41.22 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  30.17 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  45.38 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  36.57 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  36.57 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  36.57 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  41.41 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  36.57 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  35.82 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  35.82 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  41.6 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  30.77 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  35.61 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  31.47 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  41.46 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  40.98 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  37.6 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  35.43 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  27.02 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  31.21 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.65 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.88 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.75 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  36.61 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  33.82 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  37.21 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  34.33 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  32.48 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.41 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  33.58 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.18 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.69 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.94 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>