106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2263 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  51.65 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  42.05 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  41.85 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.55 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  37.72 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  36.53 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.07 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.15 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.07 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.75 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  31.94 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.89 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.89 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.89 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.38 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.08 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  31.71 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  30.89 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.36 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.67 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.46 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  28.46 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  28.46 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.27 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  28.46 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.57 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  29.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.89 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  27.64 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  28.81 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.62 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.46 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.29 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  31.93 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  30.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.68 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  30.82 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.13 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.99 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.13 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  22.22 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.2 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.5 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3438  hypothetical protein  27.89 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.64 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.67 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  26.53 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3427  hypothetical protein  27.89 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  25.64 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3490  hypothetical protein  27.89 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  25.81 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  25.64 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.39 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  26.39 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.69 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.37 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  28.35 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.26 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  25.81 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.45 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  27.83 
 
 		 155 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.35 
 
 		 155 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.81 
 
 		 163 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.56 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.94 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>