More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 317 aa  638    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  69.94 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  70 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  70.47 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  64.65 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  65.12 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  64.52 
 
 		 310 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  63.41 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  62.88 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  62.88 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  62.88 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  62.79 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  60.63 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  57.88 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  61.46 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  60.87 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.52 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  57.76 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  61.15 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  59.41 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  61.49 
 
 		 301 aa  358  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  61.87 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.54 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  58.63 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  58.61 
 
 		 314 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  58.73 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 346 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  60.13 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 305 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.33 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  58.53 
 
 		 310 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  58.67 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  56.77 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  58.19 
 
 		 306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  57.33 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  55.26 
 
 		 303 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  55.66 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  56.83 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  52.85 
 
 		 319 aa  331  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  53.95 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  60.13 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.26 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.73 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  58.19 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.13 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  56.04 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.19 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  53.97 
 
 		 313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  55.03 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  52.12 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  52.03 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.74 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.23 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  51.17 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.2 
 
 		 252 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.04 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.48 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.63 
 
 		 457 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.81 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.46 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  57.75 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  45.61 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.26 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.76 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  45.27 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 496 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.22 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.31 
 
 		 238 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.83 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.85 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.22 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  43.79 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  50.85 
 
 		 258 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  51.4 
 
 		 245 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  45.45 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.45 
 
 		 247 aa  215  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  43.92 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  52.56 
 
 		 232 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  41.36 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 254 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>