More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  73.2 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  65.64 
 
 		 288 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  65.64 
 
 		 288 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  65.64 
 
 		 288 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  61.69 
 
 		 300 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  63.57 
 
 		 290 aa  345  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  60.14 
 
 		 296 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  64.26 
 
 		 291 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  60.69 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  67.02 
 
 		 300 aa  331  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  59.04 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  57.68 
 
 		 291 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  60.14 
 
 		 304 aa  324  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  61.75 
 
 		 307 aa  322  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  62.19 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  57.6 
 
 		 288 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  58.57 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  56.89 
 
 		 287 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  58.87 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  56.64 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  57.09 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  59.86 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  57.95 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  56.34 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  54.04 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.24 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  55.78 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  56.41 
 
 		 315 aa  268  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  56.14 
 
 		 335 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  57.19 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  52.8 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  54.55 
 
 		 581 aa  262  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  51.61 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  50.48 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  51.36 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  44.65 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.39 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  43.06 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  41.94 
 
 		 355 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.4 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  40.89 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  45.75 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  41.2 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  45.5 
 
 		 355 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  44.34 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  42.81 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.29 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  42.23 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.95 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39.75 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  41.98 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  43.6 
 
 		 382 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41 
 
 		 353 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 366 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.3 
 
 		 357 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  43.3 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  43.3 
 
 		 351 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.67 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.68 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 		 362 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  45.58 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.95 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.12 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  43.41 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 381 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  42.59 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.38 
 
 		 372 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 		 351 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.19 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.67 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.59 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.28 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 419 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  36.21 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>