190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  100 
 
 		 167 aa  325  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2409  protein of unknown function DUF421  58.68 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000149876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  34.73 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  38.79 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  39.87 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  37.33 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  37.75 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  32.73 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  37.75 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  28.48 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  37.09 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.78 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.34 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  27.33 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  30.46 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  34.64 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  32.45 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  23.57 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  30.41 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  27.97 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.15 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  27.52 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  24.66 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  29.81 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25.93 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.12 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.2 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  28.38 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  27.89 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.9 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  29.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  26.19 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.76 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.19 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.19 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.19 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  29.87 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  34.42 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  25.19 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  25.19 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  26.53 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.67 
 
 		 235 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  25.33 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  32.7 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  23.78 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  23.08 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.06 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  25.97 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  27.56 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  26.53 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.22 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25.5 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  27.56 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.57 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  26.99 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  23.65 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  29.86 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.21 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  29.58 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  31.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  27.08 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  27.08 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  27.08 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  23.49 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  24.5 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  26.39 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  23.78 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  27.71 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  34.69 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  25.93 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  26.57 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>