More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 351 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  73.99 
 
 		 349 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  71.47 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  67.15 
 
 		 350 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  67.15 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  60.92 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  58.46 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  51.53 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  48.79 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  50.15 
 
 		 346 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  50.91 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  50.15 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  48.62 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  51.5 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  50.61 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.3 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  47.87 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  47.87 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  47.87 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  48.02 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  48.48 
 
 		 351 aa  278  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  47.41 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.2 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  49.07 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  47.26 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  46.71 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  47.59 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  44.85 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  48.93 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  47.31 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  44.55 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  44.51 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  44.35 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  44.35 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  43.56 
 
 		 343 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  48.05 
 
 		 345 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  43.03 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  42.94 
 
 		 343 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  43.87 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  46.81 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  42.55 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  42.55 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  42.55 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  43.28 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  47.58 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  45.83 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  45.67 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  45.32 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.14 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.05 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.2 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.77 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.04 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  34.28 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  27.53 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  33.78 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  34.48 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  37.61 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.58 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.25 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  32.89 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  32.89 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.89 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.26 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.94 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  31 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.04 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.59 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  29.41 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.94 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  29.41 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  29.41 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  31.4 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.19 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.38 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.36 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.22 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  34.97 
 
 		 311 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  29.59 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  34.97 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.25 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.03 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  33.92 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 289 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.99 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.57 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.49 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  26.61 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.49 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.41 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  29.25 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  33.7 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>