More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 448 aa  875    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.06 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.65 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.19 
 
 		 455 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.19 
 
 		 455 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  65.83 
 
 		 446 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  63.62 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  68.46 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  67.22 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.87 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  63.01 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  53.69 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.35 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  56.81 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.86 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  53.85 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  56.57 
 
 		 427 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.76 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.46 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.75 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  50.32 
 
 		 363 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  52.52 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  49.82 
 
 		 321 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  55.73 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.58 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  46.46 
 
 		 271 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.41 
 
 		 251 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.41 
 
 		 251 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 253 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  48.42 
 
 		 283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  54.82 
 
 		 264 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  48.58 
 
 		 244 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  46.59 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  40.31 
 
 		 257 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.96 
 
 		 241 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  42.98 
 
 		 232 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  47.79 
 
 		 251 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.31 
 
 		 257 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  43.2 
 
 		 252 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  45.95 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 260 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 256 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.64 
 
 		 250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.55 
 
 		 256 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 254 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  49.07 
 
 		 273 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.05 
 
 		 256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.79 
 
 		 251 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.06 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.08 
 
 		 248 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.01 
 
 		 248 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.07 
 
 		 248 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.85 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.29 
 
 		 245 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.11 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  35 
 
 		 249 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.94 
 
 		 250 aa  106  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  34.25 
 
 		 217 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.39 
 
 		 268 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.66 
 
 		 251 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.12 
 
 		 244 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  34.82 
 
 		 257 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.08 
 
 		 227 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  37.08 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  36.27 
 
 		 200 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.39 
 
 		 350 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  29.26 
 
 		 234 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.71 
 
 		 209 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.16 
 
 		 256 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.05 
 
 		 257 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.8 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  35.67 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  27.95 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  36.17 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.73 
 
 		 269 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  37.18 
 
 		 242 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  26.13 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.01 
 
 		 187 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.65 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.86 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.4 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.29 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.94 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.76 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.21 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.26 
 
 		 170 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.55 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.87 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.57 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.8 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.29 
 
 		 180 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.1 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.23 
 
 		 191 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.56 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.8 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.14 
 
 		 168 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>