233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1784 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 444 aa  883    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  49.77 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  46.65 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 		 450 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  43.44 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  44.27 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  44.9 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  45.48 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  42.26 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  44.04 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  44.26 
 
 		 438 aa  334  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  45.65 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  43.78 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  43.19 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  44.55 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.79 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.42 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.8 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  39.44 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.52 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  41.92 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.76 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.29 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.65 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  44.42 
 
 		 392 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  41.88 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.57 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 		 389 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 		 389 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  41.16 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  42.26 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  43.26 
 
 		 398 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.28 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  39.15 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  41.2 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  42.99 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  41.81 
 
 		 404 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.14 
 
 		 389 aa  299  9e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.14 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.56 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.62 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.81 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.39 
 
 		 391 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.57 
 
 		 391 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  37.27 
 
 		 444 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  37.64 
 
 		 453 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  44.92 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.45 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  37.88 
 
 		 453 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.12 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.03 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  39.67 
 
 		 379 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  41.59 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.23 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  36.81 
 
 		 465 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  37.1 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  40.14 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.42 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.45 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  40.28 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.64 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  41.71 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  40.05 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.8 
 
 		 399 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.57 
 
 		 382 aa  282  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.91 
 
 		 395 aa  282  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.47 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.9 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.39 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  42.62 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  40 
 
 		 387 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 		 381 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  37.44 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  42.62 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  38.28 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>