289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1172 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  50 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  40.13 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  41.45 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  40.13 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  42.76 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  38.16 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  30.77 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  32.48 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  44.71 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  32.3 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.3 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  30.57 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  32.48 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  26.28 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  34.94 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  31.25 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  27.22 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  41.77 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  26.58 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  26.58 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  32.91 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  33.73 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  32.9 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  32.73 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  41.67 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  31.48 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  31.68 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  28.75 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  35.92 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  28.75 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  28.12 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.56 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  38.37 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  29.34 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  29.77 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  29.77 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  28.66 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  33.03 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  29.77 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  35.11 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  28.85 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  31.68 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  29.34 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  27.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  28.12 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1137  protein of unknown function DUF163  39.77 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240121  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  29.81 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  22.93 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  42.53 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  32.26 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  28.21 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  32.32 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  32.73 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  37.04 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  40.7 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  33.71 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>