289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0250 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  64.24 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  61.59 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  63.09 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  48.99 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  49.67 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  49.01 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  42.76 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  42.53 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  35.29 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  41.18 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.08 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  32.09 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  37.08 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  42.22 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  32.85 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  32.85 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  35.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  29.94 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  40.23 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  32.64 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  35.29 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  33.55 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.37 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.64 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  36.05 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  36.05 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.3 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  38.78 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35.82 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  39.08 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  42.17 
 
 		 166 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  31.47 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  42.17 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  37.93 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  34.75 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  32.9 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  29.81 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  38.55 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  25.81 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  36.27 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  43.37 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  29.19 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  30.43 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  30.32 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  30.32 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  36.27 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  34.88 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  25.81 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.24 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  39.53 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  36.47 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  31.4 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  29.19 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  27.39 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  32.2 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  34.88 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  41.98 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  37.35 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  40.23 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  40.96 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  32.62 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  40 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  33.8 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>