289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0533 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  51.66 
 
 
151 aa  168  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  49.67 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  154  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  44.37 
 
 
151 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  141  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  49.01 
 
 
149 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  45.03 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  44.37 
 
 
149 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  30.86 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  30.86 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.72 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  31.29 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.76 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  31.9 
 
 
159 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  32.9 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.41 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  29.45 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  32.69 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  29.75 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  29.45 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  31.68 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  29.63 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  32.92 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  29.01 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  31.06 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  29.03 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  32.52 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  29.81 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  28.75 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  29.38 
 
 
177 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  31.61 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  30.86 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  31.62 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  27.5 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  42.35 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  29.49 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.48 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  27.39 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  26.75 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  34.25 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  31.51 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  27.39 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  37.08 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  29.63 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  30.67 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  36.47 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  27.1 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  41.57 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  40.96 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  26.75 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  37.08 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  28.48 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  28.57 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  28.39 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  29.63 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  36.47 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  36.47 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  30.13 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  40.96 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  30.82 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  24.84 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  27.67 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  28.85 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  34.88 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  39.76 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  37.78 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  32.19 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  36.47 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  31.19 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  40.24 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  28.67 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  35.23 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  27.04 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  34.12 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  28.67 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  32.94 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>